Araştırma

Projeler

Süzek TOYürütücü, TUBITAK 2232,Kemoenformatik modelleme veritabanından anahtar kelime ayıklanması için metin madenciliği tekniklerinin geliştirilmesi, 23 Ekim 2013-23 Ekim 2015

Süzek BEYürütücü,TUBITAK 2232, İnsan Proteinleri için En Doğru Çoklu Dizi Hizalamalarının Hesaplanması ve Hastalığa Neden Olan Bilinen Tek Amino Asit Polimorfizmleri (SAP) Tahmini, 23 Ekim 2013-23 Ekim 2015

Süzek TO, Araştırmacı, Yürütücü:Dr.Kemal Ergin(ADU), TUBITAK 1001,Pankreas kanserinde elongasyon inisiyasyon faktör 2 alfa (eIF2a)’nın siRNA (small interfering RNA) ile susturulması (in vitro ve in vivo) sonrasında hücre ölümünün araştırılması, 11 Agustos 2014-11 Agustos 2016

 

SCI Yayınlar (2013-2015)

Suzek BE, Wang Y, Huang H, McGarvey P, Mazumder R, Wu CH and the UniProt Consortium. UniRef Clusters: A comprehensive and scalable alternative for improving sequence similarity searches. Bioinformatics. November 13,2014 doi:10.1093/bioinformatics/btu739

McGarvey PB,Suzek BE, Baraniuk JB, Rao S,Conkright B,Lababidi S,Sutherland A,Forshee R, Madhavan S. In silico analysis of autoimmune diseases and genetic relationships to vaccination against infectious diseases, BMC Immunology, 2014 Dec 2 – 2014

Poux S, Magrane M, Arighi CN, Bridge A, O’Donovan C, Laiho K; UniProt Consortium (Suzek BE co-author) . Expert curation in UniProtKB: a case study on dealing with conflicting and erroneous data. Database (Oxford). 2014 Mar 12;2014:bau016. doi: 10.1093/database/bau016.

Wang Y, Suzek TO, Zhang J, Wang J, He S, Cheng T, Shoemaker BA, Gindulyte A, Bryant H, PubChem BioAssay: 2014 update, Nucleic Acids Research,2014 Jan;42 (Database issue):D1075-82

Chen C, Li Z, Huang H, Suzek BE, Wu CH; UniProt Consortium. A fast Peptide Match service for UniProt Knowledgebase. Bioinformatics. 2013 Nov 1;29(21):2808-9. doi: 10.1093/bioinformatics/btt484. Epub 2013 Aug 19.

Buckler AJ, Ouellette M, Danagoulian J, Wernsing G, Liu TT, Savig E, Suzek BE, Rubin DL, Paik D. Quantitative imaging biomarker ontology (QIBO) for knowledge representation of biomedical imaging biomarkers. J Digit Imaging. 2013 Aug;26(4):630-41. doi: 10.1007/s10278-013-9599-2.

Buckler AJ, Paik D, Ouellette M, Danagoulian J, Wernsing G,Suzek BE. A novel knowledge representation framework for the statistical validation of quantitative imaging biomarkers. J Digit Imaging. 2013 Aug;26(4):614-29. doi:10.1007/s10278-013-9598-3.

Conference Publications (2013-2015)

Onal-Suzek T,Wang Y, “Text-mining based evaluation of NIH Chemical Probes”, The 3rd Biomedical Informatics Symposium at Georgetown University,Oct 2nd 2014, Washington DC

Suzek, B. E., “Where are the disease-associated single amino acid polymorphisms located on proteins?”,The 3rd Biomedical Informatics Symposium at Georgetown University,Oct 2nd 2014, Washington DC

iletişim
Biyoinformatik Yüksek Lisans Anabilim Dalı
 
Fen Bilimleri Enstitüsü
 
Muğla Sıtkı Koçman Üniversitesi
 
Kötekli/Muğla/Türkiye
 
0252 2115484

tugbasuzek@mu.edu.tr

Yukarı Çık